Revista de farmacogenómica y farmacoproteómica

Abstracto

Cuantificación de la visualización de datos de mapas de calor para análisis de alto rendimiento

Pablo Juneau

Los mapas de calor se han utilizado como un medio para visualizar información de alta densidad en entornos tan diversos como la astronomía, el análisis empresarial y la meteorología . Los equipos de investigación de biología de descubrimiento también han utilizado mapas de calor para visualizar grupos de genes en investigaciones genómicas o para estudiar la distribución de aminoácidos en el análisis de secuencias de proteínas. Los paquetes de software disponibles comercialmente, como Spotfire® o SAS JMP®, brindan a los investigadores científicos la capacidad de construir mapas de calor y visualizar información de los estudios, pero no ofrecen ninguna forma de estadística de resumen que sería útil en investigaciones de alto rendimiento que comparen los resultados de una gran cantidad de visualizaciones de datos simultáneamente o vean cambios en la visualización longitudinalmente (a lo largo del tiempo).

Anteriormente, Juneau sugirió el uso de la caracterización de Plotnick de la lacunaridad (1996) para la visualización de datos de mapas de calor bidimensionales en dos colores o tonos. Para c (c>2) tonos discretos (en un mapa monocromático) o matices (en una visualización a todo color), el autor sugerirá una modificación del enfoque de Plotnick utilizando el enfoque subyacente de caja deslizante desarrollado por Allain y Cloitre, pero con una alteración en los medios de conteo de características.