Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Detección y cuantificación rápida de Fusarium udum en muestras de suelo y plantas mediante PCR en tiempo real

Sukumar Mesapogu, Bandamaravuri Kishore Babu, Achala Bakshi, Somasani S. Reddy, Sangeeta Saxena, Alok K. Srivastava y Dilip K. Arora

Se desarrolló un ensayo de detección basado en PCR en tiempo real para Fusarium udum, que causa el marchitamiento vascular del gandul. El gen de la histona 3 de F. udum se utilizó para diseñar iniciadores y sondas específicos de la especie. Se realizó un estudio comparativo para desarrollar un procedimiento confiable y reproducible para la detección y cuantificación de F. udum a partir de diversas muestras. La sensibilidad y especificidad de los oligonucleótidos se evaluaron mediante hibridación por transferencia puntual, ensayos de PCR estándar y en tiempo real. La sonda HFUSP mostró un alto grado de sensibilidad para el ADN obtenido de cultivos puros de F. udum en comparación con el de muestras de ADN ambientales. El ensayo de qPCR diferenció específicamente a F. udum de especies estrechamente relacionadas de Fusarium, otros microbios de prueba y muestras ambientales. La curva de fusión única en 84,17 y una banda monomórfica de 200 pb indican la especificidad y autenticidad de los ensayos de PCR. Por lo tanto, el ensayo de PCR en tiempo real se puede utilizar como un procedimiento rápido y eficaz que puede detectar cantidades mínimas de F. udum en entornos complejos. Por lo tanto, el ensayo de PCR en tiempo real demostrado en el presente estudio se puede utilizar con éxito para la detección y el seguimiento de F. udum para la infección temprana y la epidemiología de la enfermedad del marchitamiento vascular del guandú.