Tecnología genética

Abstracto

sdRNA: siRNA con una semilla de ADN para una interferencia de ARN específica y eficiente para el gen objetivo

Kumiko Ui-Tei

La interferencia de ARN (ARNi), un proceso mediante el cual los ARN interferentes pequeños (ARNip) inducen el silenciamiento génico postranscripcional específico de secuencia, se reconoce comúnmente como una herramienta poderosa no solo para la genómica funcional sino también para aplicaciones terapéuticas. Para lograr una función génica objetivo precisa y aplicaciones terapéuticas exitosas, es necesario seleccionar un gen específico y eficiente.

ARNi con efectos mínimos fuera del objetivo. Descubrimos que la capacidad de inducir efectos fuera del objetivo en genes no deseados está fuertemente correlacionada con la estabilidad termodinámica del dúplex formado entre la región semilla (posiciones 2-8 desde el extremo 5' de la cadena guía del ARNi) y el ARNm objetivo. En consonancia con esta propiedad, descubrimos que el ARNi quimérico de ADN-ARN (chiARN) con desoxirribonucleótidos en los ocho nucleótidos proximales 5' de la cadena guía y los nucleótidos complementarios en la cadena pasajera prácticamente no ejercía ningún efecto fuera del objetivo debido a la baja estabilidad del dúplex de ADN-ARN en el apareamiento de bases semilla-diana. Sin embargo, las actividades de ARNi correspondientes para los genes objetivo primarios también se redujeron a una décima parte en promedio por las sustituciones de ADN. Aquí, informamos que los ARNi con siete desoxirribonucleótidos exclusivamente en la región semilla (sdRNA) pueden exhibir una especificidad de objetivo eficiente, pero la actividad de ARNi reducida por el efecto fuera del objetivo.