Genética hereditaria: investigación actual

Abstracto

Estudios sobre la caracterización molecular del gen DREB en arroz índica (Oryza sativa L.)

Jadhao KR, Samal KC, Pradhan SK y Rout GR

Se ha identificado un número de genes candidatos potenciales (CG) mediante métodos transgénicos y de transcriptoma que intervienen en las respuestas adaptativas a la sequía en los cereales. Uno de estos genes que confiere tolerancia a la sequía es la familia de genes DREB. La exploración de la variación genética/alélica dentro de la familia de genes DREB es un prerrequisito importante para una mejor comprensión de la tolerancia al estrés. La presente investigación tiene como objetivo estudiar la variación alélica en la secuencia de nucleótidos dentro del gen DREB de diferentes cultivares de arroz necesarios para el programa de mejora de cultivos. Se utilizaron diez cultivares de arroz de tierras altas y tierras bajas para la caracterización molecular y la minería de alelos. Los resultados mostraron que el gen DREB se encontró en todo el germoplasma analizado y se envió al NCBI GenBank (números de acceso KF 545561 a KF 545569). El análisis bioinformático mostró una identidad del 100 por ciento con el dominio de unión al ADN AP2 de 59 aminoácidos que mostró tres láminas conservadas con residuos conservados de valina 14 y ácido glutámico 19. El dominio AP2 de la proteína DREB putativa se encontró rico en aminoácidos alanina (17,6%) y arginina (15,7%) con una masa molecular predicha de 5,89 kDa y un punto isoeléctrico (pI) de 10,38. Se observa que las secuencias de nucleótidos del gen DREB se verificaron con el análisis del polimorfismo de ADN, de los cuales se identificaron 196 sitios invariables (monomórficos) y 8 variables (polimórficos), es decir, sitios segregantes, incluidos 9 números de mutación y 5 haplotipos. La diversidad de haplotipos (genes) fue de 0,756; la diversidad de varianza y desviación estándar fueron de 0,01678 y 0,130 respectivamente. El resultado mostró que la variedad 'Khandagiri' mostró un 97,5% de similitud con todas las accesiones del gen DREB del arroz y un 0,036% de divergencia evolutiva con la accesión AK121956 presente en la base de datos. Esto podría haber mejorado la capacidad del gen DREB como factor de transcripción y conducir a una mejor adopción y capacidad de tolerancia del cultivar durante la sequía.