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Abstracto
Formación de un puente de tetrasulfuro (TTSB): una estructura intermedia extraordinaria en la arquitectura y dinámica de la molécula gp120 del VIH-1
Harry F. Crevecoeur
La gp120, una de las moléculas que ejecuta la entrada viral del VIH en las células CD4+, tiene varios puentes disulfuro alostéricos. En este estudio, exploramos la dinámica de estos posibles puentes disulfuro en la configuración 3-D (basada en cristalografía) y análisis DBA de la UNSW de varios cristales de gp120. Los datos revelan la existencia de un puente tetrasulfuro (TTSB) que, junto con un puente disulfuro, mantiene dos láminas beta perpendiculares (es decir, V3 y V4) aproximadas en la arquitectura de la gp120, al tiempo que permite una transferencia segura de energía entre los enlaces alostéricos. Los análisis de múltiples cristales de gp120 revelan la existencia del TTSB como un intermediario en lugar de un punto de referencia constante, lo que implica funciones más complejas que solo atributos estructurales. Este TTSB, que se observa en varios cristales de gp120, en varias cepas y clados del VIH-1, se demuestra mediante varios programas informáticos de renderización y algunos también se detectan, informan y caracterizan mediante el motor de análisis de enlaces disulfuro (DBA) de la UNSW. Este puente de tetrasulfuro conecta el enlace alostérico Cys296-Cys331 a Cys385-Cys418, a veces como CYS331:SG-CYS385:SG, y a veces como CYS331:SG-CYS418:SG. Además, en los cristales 3TIH, 4LSR y 4R4N, también observamos un estado intermedio del TTSB donde presenta una formación triangular en la que el átomo de azufre CYS331:SG se une a CYS385:SG y CYS418:SG simultáneamente, lo que representa un intermediario importante en la dinámica funcional de la molécula de gp120. La presencia de esta estructura extraordinaria (TTSB) apunta a algunos conocimientos intrigantes sobre el diseño y la mecánica multifuncional, así como algunas fragilidades complejas de la molécula gp120, exponiendo un nuevo objetivo para la terapia antiviral.