Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Análisis filogenético y de la variación de la secuencia del genoma mitocondrial completo de la morera

Guo Liangliang, Shi Yisu, Wu Mengmeng, Michael Ackah, Qiang Lin, Weiguo Zhao*

Antecedentes: La morera es un cultivo de importancia económica, tolerante a diversas condiciones ambientales. La planta (hojas) se utiliza para alimentar a los gusanos de seda y para la jardinería, y posee grandes perspectivas de desarrollo y valor para la investigación científica. Las mitocondrias son la central eléctrica de las plantas que produce la energía necesaria para llevar a cabo los procesos vitales.

Objetivo: El genoma mitocondrial (mt) de las plantas funciona como una central eléctrica que produce la energía necesaria para llevar a cabo los procesos vitales de las plantas. Sin embargo, el genoma mitocondrial (mt) de la planta de morera aún no se ha explorado. Este estudio investigó el genoma mt de Morus L ( M. atropurpurea y M. multicaulis ) y lo comparó con otras especies de plantas.

Métodos: El genoma mitocondrial de Morus L ( M. atropurpurea y M. multicaulis ) se secuenció utilizando Oxford Nanopore Prometh ION y los datos se recopilaron y analizaron y luego se compararon con el genoma mitocondrial de otras plantas. Se realizó un análisis filogenético para estudiar el estado evolutivo de las plantas de morera estudiadas.

Resultados: El genoma circular mt de M. multicaulis tiene una longitud de 361.546 pb, contiene 54 genes, incluyendo 31 genes codificantes de proteínas, 20 genes de ARNt y 3 genes de ARNr y composición de A (27,38%), T (27,20%), C (22,63%) y G (22,79%). Por otro lado, el genoma circular mt de M. atropurpurea tiene una longitud de 395.412 pb, comprende C+G (45,50%), incluyendo 57 genes funcionales que contienen 2 genes de ARNr, 22 genes de ARNt y 32 PCGs. Existen repeticiones de secuencia, genes de edición de ARN y migración de cp a mt en el genoma mt de M. multicaulis y M. atropurpurea .

El análisis filogenético basado en los genomas mt completos de Morus y otras 28 especies refleja un estado evolutivo y taxonómico exacto.

Conclusión: Descubrimos que el genoma mt de la especie Morus es circular, con M. multicaulis con una longitud de 361.546 pb. 54 genes, incluidos 31 genes codificadores de proteínas, 20 genes de ARNt y 3 genes de ARNr. Además, se descubrió que M. atropurpurea tiene una longitud de 395.412 pb. Además, un total de 57 genes contienen 32 genes codificadores de proteínas, 22 ARNt y 3 ARNr que fueron anotados en el genoma. Los resultados proporcionarán una comprensión integral del genoma mt de Morus y pueden ayudar en futuros estudios y en el mejoramiento de variedades de morera.