Revista de Enfermedades Infecciosas y Diagnóstico

Abstracto

El impacto de los ciclos de congelación y descongelación en la integridad de los fluidos de cultivo viral del SARS-CoV-2 y las muestras clínicas remanentes en las pruebas de antígenos o ácidos nucleicos

Hajirah Noor Hussain, Hali Weeks, Derek Zhou, Divya Joseph, Brooke Lam, Haidong Xu, Chushi Zhang, Keqin Gregg, Wenli Zhou*

La conservación a temperaturas ultrabajas ha sido un estándar de oro para el almacenamiento a largo plazo de muchos tipos de muestras clínicas, incluido el virus SARS-CoV-2. Las muestras congeladas se pueden transportar fácilmente y analizar más tarde. Además, las muestras remanentes congeladas desidentificadas son recursos para muchos estudios preclínicos o clínicos. Por lo tanto, es crucial comprender si los ciclos de congelación y descongelación (FTC) pueden afectar negativamente el rendimiento de la prueba del SARS-CoV-2 cuando se analizan muestras congeladas. Algunos estudios iniciales sugieren que los FTC aumentaron el umbral de ciclo (Ct) de la PCR en tiempo real con transcripción inversa (RT-PCR o RT-qPCR), lo que indica la posible degradación del ácido nucleico del SARS-CoV-2 después de los FTC, mientras que otros no informaron ningún cambio significativo en los ácidos nucleicos del SARS-CoV-2 después de los FTC. Además, apenas se informa sobre el impacto de los FTC en el rendimiento de la prueba de antígeno del SARS-CoV-2.

En este estudio, realizamos pruebas pareadas de ácidos nucleicos y antígenos rápidos en las mismas muestras para investigar y comparar directamente cómo los FTC afectan el rendimiento de dos tipos de pruebas. Se estudiaron muestras de fluido de cultivo viral inactivado y muestras de remanentes clínicos. Nuestros resultados mostraron que los FTC tuvieron efectos negativos mínimos en el rendimiento de la prueba rápida de antígenos del SARS-CoV-2, y los resultados de la prueba se mantuvieron en gran medida consistentes en todas las FTC, mientras que los valores de Ct de la RT-PCR aumentaron con el aumento de los números de FTC. Además, nuestros datos también demostraron que el SARS-CoV-2 se conserva mejor en el medio de transporte viral (VTM) que en solución salina tamponada con fosfato (PBS) durante las FTC con respecto a las pruebas de ácidos nucleicos.