Rubí juan
Uno de los clados más comunes de Thaumarchaeota mesófila y termófila son las arqueas oxidantes de amonio. Desempeñan un papel importante en el ciclo global del nitrógeno y se pueden encontrar en hábitats terrestres, marinos y geotérmicos. Su existencia en reactores de lodos activados y plantas de tratamiento de aguas residuales sugiere que, al igual que sus contrapartes bacterianas, desempeñan un papel en la eliminación del amonio. Las arqueas oxidantes de amonio (AOA) se combinan con bacterias oxidantes de amonio anaeróbicas en las zonas de mínimo oxígeno (OMZ), lo que provoca hasta el 50% de la pérdida de nitrógeno del océano.