Revista de farmacogenómica y farmacoproteómica

Abstracto

Hacia una comprensión integral del reguloma de miRNA y las redes de interacción de miRNA

Joseph J Nalluri, Debmalya Barh, Vasco Azevedo y Preetam Ghosh

Los miRNA son reguladores vitales de la expresión génica postranscripcional. La desregulación de los miRNA conduce a la susceptibilidad a muchas enfermedades, especialmente cánceres. Sus complicados mecanismos moleculares que comprenden factores de transcripción ascendentes, objetivos descendentes, procesos funcionales y biológicos y regulaciones de enfermedades aún no se comprenden por completo. Por lo tanto, comprender la red reguladora de miRNA de manera integral es fundamental para modular sus funciones y desarrollar terapias con miRNA. En la actualidad, existen varias bases de datos y herramientas independientes que contienen información específica sobre partes de un reguloma de miRNA en silos, lo que impide una comprensión holística del mecanismo molecular de miRNA. Por lo tanto, la integración de todos los conjuntos de datos dispersos de manera cohesiva para obtener una comprensión general de la influencia contributiva y la efluencia de la maquinaria de un reguloma de miRNA es fundamental. En este artículo, presentamos un informe de caso sobre miRegulome, una primera base de conocimiento integral integrada de regulomas de miRNA y herramientas analíticas de redes de interacción de miRNA. miRegulome integra los módulos moleculares esenciales de un reguloma de miRNA en una plataforma cohesiva. También analizamos las interacciones entre microARN y enfermedades a partir de miRegulome y diseñamos estrategias de teoría de grafos para analizarlas. También presentamos un diseño de nivel superior para un repositorio de base de datos mejorado para el análisis integral de datos que recopila diversos conjuntos de datos relacionados con la biología de los microARN; y presentamos la necesidad y los desafíos para el desarrollo de nuevos algoritmos para predecir nuevas interacciones entre microARN, genes, factores de transcripción y enfermedades.