Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Uso del gen del factor de elongación de la traducción para detectar y diagnosticar específicamente Fusarium xylaroides , un agente causante de la enfermedad del marchitamiento del café en Etiopía y África oriental y central.

Olal S, Olango N, Kiggundu A, Ochwo S, Adriko J, Nanteza A, Matovu E, Lubega GW, Kagezi G, Hakiza GJ, Wagoire WW, Rutherford MA y Opiyo SO

El presente estudio presenta el primer informe sobre la aplicación de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) basada en ADN para la detección y el diagnóstico específicos de F. usarium xylarioides (anamorfo: G ibberrela xylarioides). Fusarium xylarioides es el agente causal de la enfermedad del marchitamiento del café (traqueomicosis), y la enfermedad es la restricción económica más importante en la producción de café Robusta en Uganda. El patógeno tiene dos razas, una patógena para el café Robusta y la otra para el café Arábica, y no al revés. Su diagnóstico de laboratorio se ha basado principalmente en la microscopía, que es lenta, tiene un poder discriminatorio bajo, requiere mucha experiencia, solo se puede aplicar en plantas hospedantes con síntomas y desde entonces no ha podido detectar el patógeno en el suelo. Traducción El gen del factor de elongación-1α (TEF-1α) de un F. xylarioides aislado de una planta de café Robusta infectada se amplificó mediante un cebador específico del género Fusarium y luego se secuenció el producto de PCR. Luego, los datos de la secuencia se utilizaron para diseñar el cebador específico. Se encontró que el producto BLAST del primer coincidía únicamente con las secuencias de F. xylarioides que comprendían el 75 % de la raza patógena para el café Robusta y el 25 % para el café Arábica. La prueba in vitro por PCR mostró que el primer era específico únicamente para F. xylarioides, amplificando un producto de 284 pb y fue capaz de diferenciar a F. xylarioides de todas las especies estrechamente relacionadas de Fusarium y otros patógenos de plantas evaluados. Más aún, fue capaz de amplificar el ADN de todos los aislamientos de F. xylarioides de diferentes regiones de Uganda y amplificó concentraciones de ADN tan pequeñas como 0,78 ng/µL.