Medicina Tropical y Cirugía

Abstracto

La secuenciación del genoma completo de ómicron identificó múltiples brotes y eventos de introducción en la India durante noviembre de 2021 y enero de 2022.

Shreedhanya D. Marathe, Varun Shamanna, Geetha Nagaraj, Nischita S, Muthumeenakshi Bhaskaran, KL Ravi Kumar

La variante preocupante (VOC), Ómicron, es la variante predominante que circula en todo el mundo de la pandemia del SARS-CoV-2 durante la tercera ola, incluida la India. La Organización Mundial de la Salud ha designado esta variante altamente mutada como VOC debido a su alta transmisibilidad y riesgo de reinfección. Se realizó la secuenciación y el análisis del genoma completo de muestras positivas a la PCR del SARS-CoV-2 entre diciembre de 2021 y enero de 2022. De las 133 variantes de Ómicron detectadas, se realizó un análisis genómico contextualizándolas con 1586 genomas completos de Ómicron de la India obtenidos de GISAID. La prevalencia de la variante Ómicron en la India ha aumentado en una fase logarítmica en 3 meses en la mayoría de las ciudades metropolitanas. Con los limitados datos de secuenciación disponibles, se identificó que el sublinaje BA.1 fue predominante en la India desde noviembre de 2021 hasta enero de 2022. Además, la primera secuencia del sublinaje BA.2 se envió desde Delhi recién a mediados de diciembre de 2021. Los dos brotes observados fueron de la variante BA.2 y se descubrió que se propagaron a varias ciudades en poco tiempo. La rápida propagación y las mutaciones específicas en las muestras del brote de Omicron indican que la variante es altamente transmisible en comparación con variantes anteriores. El estudio muestra la importancia de la secuencia genómica para identificar la aparición de grupos y tomar medidas para prevenir más eventos de propagación.