Revista de farmacogenómica y farmacoproteómica

Abstracto

Más allá de los IC 50 : hacia métodos estadísticos robustos para estudios de asociación in vitro

Andrew Beam y Alison Motsinger-Reif

Los ensayos de citotoxicidad de líneas celulares se han convertido en enfoques cada vez más populares para los estudios genéticos y genómicos de la respuesta citotóxica diferencial. Hay un número cada vez mayor de historias de éxito, pero relativamente poca evaluación de los enfoques estadísticos utilizados en tales estudios. En la gran mayoría de estos estudios, la respuesta a la concentración se resume utilizando enfoques de ajuste de curvas y luego se utilizan medidas de resumen como fenotipo en estudios de asociación genética posteriores. La curva generalmente se resume mediante un solo parámetro, como el punto de inflexión de la curva (por ejemplo, la CE50/CI50). Este modelo hace suposiciones importantes y tiene limitaciones estadísticas que deben considerarse. En la presente revisión, analizamos las limitaciones de la CE50/CI50 como fenotipo en estudios de asociación y destacamos algunas limitaciones potenciales con un experimento de simulación. Finalmente, analizamos algunos enfoques de análisis alternativos que han demostrado ser más sólidos.