Tecnología de fermentación

Abstracto

Prevalencia de los filos Proteobacteria y Armatimonadetes en un fotobiorreactor bajo un proceso de producción libre de carbono y nitrógeno

Patricia Tamez-Guerra, Jesús O. Zúñiga-Sánchez, Alonso A. Orozco-Flores, José A. Valadez-Lira, Cristina Rodríguez-Padilla, Rosa O. Cañizares-Villanueva y Ricardo Gómez-Flores

En procariotas, la población autótrofa dentro del reino bacteriano presenta un gran potencial biotecnológico. Para el análisis taxonómico de especies, la secuencia que codifica el gen de la subunidad pequeña del ARN ribosomal (ARNr 16S) es actualmente la técnica más confiable para la clasificación filogenética bacteriana. La secuenciación puede definir la diversidad poblacional y la importancia ecológica dentro de un hábitat. El estudio de la dinámica poblacional de bacterias autótrofas en un fotobiorreactor utilizando un medio de cultivo libre de carbono y nitrógeno podría proporcionar información sobre la dinámica de sucesión en condiciones controladas. El objetivo de este estudio fue identificar las poblaciones bacterianas presentes en un fotobiorreactor mediante la comparación de secuencias de amplicones de ARNr 16S a partir de muestras tomadas a los 0, 7 y 14 días de fermentación. La mayoría de los clones identificados fueron descritos a nivel de género de los siguientes filos: Proteobacteria (40%), Armatimonadetes (35%), Firmicutes (17,5%), Actinobacteria (2,5%) y Cyanobacteria/Chloroplast (2,5%). Se han reportado cepas bacterianas de estos filos en ambientes acuáticos y se consideraron no cultivables; sin embargo, las secuencias indicaron la presencia de los clones A-123 (ID: HQ860522.1) desde el tiempo 0 y YHS25 (GU305825.1) después de 7 días de cultivo. Nuestros hallazgos demostraron la presencia mayoritaria de poblaciones bacterianas autótrofas de los filos Proteobacteria y Armatimonadetes, que crecieron en condiciones de cultivo artificial en un fotobiorreactor.