Revista de farmacogenómica y farmacoproteómica

Abstracto

Prevalencia de variantes raras potencialmente importantes para la respuesta a los medicamentos utilizados para el tratamiento de la ECV en la población lituana

Pranculis A, RanÄ elis T, AmbrozaitytÄ— L, UktverytÄ— I, DomarkienÄ— I, BurokienÄ— N, KuÄ inskienÄ— ZA y KuÄ inskas V

La enfermedad cardiovascular (ECV) es una de las principales causas de muerte entre los europeos y en todo el mundo. Los principales factores que se consideran relevantes para la eficacia o las reacciones adversas a los medicamentos (RAM) causadas por los medicamentos utilizados para el tratamiento de la ECV se han identificado a través de estudios GWAS que utilizan principalmente matrices de genotipado de variantes comunes de baja densidad. En este estudio, se llevó a cabo la secuenciación completa del exoma (WES) para identificar variantes genómicas relevantes para el tratamiento de la ECV. El grupo de estudio incluyó a 98 individuos (49 hombres y 49 mujeres) sanos autodeclarados no relacionados de la población lituana con al menos tres generaciones de etnia lituana y residencia en la misma región etnolingüística. Después de realizar la WES, se analizaron los loci genéticos de 55 genes que se informaron como relevantes para la eficacia o las RAM causadas por los medicamentos utilizados para el tratamiento de la ECV utilizando el software LifeScopeTM y ANNOVAR. El análisis de pequeñas indels en las regiones seleccionadas reveló 13 indels por desplazamiento del marco exónico y una única variante del sitio de empalme intrónico que puede afectar la eficacia o causar ADR en pacientes tratados por ECV. Se detectaron más de 400 SNV potencialmente relevantes en diferentes frecuencias en los genes que se informó que eran importantes para el tratamiento de la ECV. El análisis de la solidez de la evidencia identificó 14 SNV con mayor probabilidad de ser relevantes para el tratamiento de la ECV. Se determinó que la distribución de frecuencia de varios alelos variantes que han demostrado ser muy importantes para el tratamiento de la ECV en el CYP2D6 (rs16947) y ADRB1 (rs1801253), así como varias variantes en los genes CYP2C9 y NAT2, eran significativamente diferentes (p < 0,05) de otras poblaciones caucásicas, lo que demuestra el beneficio potencial de las pruebas farmacogenómicas antes del tratamiento en la población lituana. La investigación se llevó a cabo en el marco del proyecto LITGEN. El proyecto LITGEN (VP1-3.1-ŠMM-07-K-01-013) fue financiado por el Fondo Social Europeo en el marco de la medida de subvención global.