La Microbiología Clínica es el estudio de cualquier organismo microscópico que pueda causar infección en humanos. Debido a que los microorganismos están muy extendidos en la naturaleza y algunos pueden causar enfermedades humanas graves, este tema a menudo se estudia por la fuente de la muestra del cuerpo: ubicación particular, tipo de líquido o tejido corporal específico. Los microbiólogos clínicos tienen que ser capaces de diferenciar entre microorganismos normales y dañinos. Por ejemplo, E.coli es un microorganismo normal en algunas partes del cuerpo todo el tiempo, pero cuando ocurre un brote de enfermedad transmitida por los alimentos, el científico de laboratorio médico puede cultivar el alimento sospechoso y realizar pruebas específicas para determinar si una cepa diferente y peligrosa de E. coli es responsable.
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