Se derivan del embrión en la etapa de blastocisto. Son células madre pluripotentes. Dan origen a todos los derivados de las tres capas germinales primarias: endodermo (estómago, colon, hígado, páncreas, intestinos, etc.), mesodermo (músculo, hueso, cartílago, tejido conjuntivo, sistema linfático, sistema circulatorio, sistema genitourinario, etc.) y ectodermo (cerebro, médula espinal, epidermis, etc.).
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