La expresión génica en células individuales varía según el tejido o la muestra de cultivo según el ciclo celular, las diferencias genéticas, epigenéticas y estocásticas. La diferenciación de células individuales se descuida en el análisis de las consecuencias funcionales de la variación genética. Se mide la expresión de 92 genes afectados por la señalización en 1440 células individuales de 15 individuos para asociar polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) con fenotipos de expresión génica, al tiempo que se tienen en cuenta las diferencias estocásticas y del ciclo celular entre las células. Los tejidos complejos pueden contener muy subpoblaciones de células pequeñas con perfiles de expresión génica únicos, y promediar los resultados de expresión génica de muchas células pueden enmascarar cambios sutiles e importantes que ocurren dentro de células individuales. Los avances técnicos en el aislamiento de células individuales,
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